非婚生子有出生证明，上男方户口还要做亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    防止虚假出生证明及身份冒用

   在现实生活中，存在一些非法获取或伪造出生证明的情况。有些人为了达到让孩子落户等目的，可能会使用虚假的出生证明。亲子鉴定可以通过科学的手段，准确验证孩子与男方之间是否存在生物学上的亲子关系，从而防止利用虚假出生证明为非亲生子女办理落户，维护户籍管理的真实性和严肃性。

    明确亲子关系

   虽然出生证明是孩子出生的一个重要凭证，但它本身无法完全确定孩子的生物学父亲。非婚生育的情况下，可能存在孩子母亲同时与多个男性有亲密关系等复杂情况，出生证明上登记的父亲信息可能不准确。通过亲子鉴定来明确亲子关系，能够避免错误登记户籍信息，保障孩子合法权益以及家庭关系的准确性。

    遵循户籍管理规定

   为了规范户籍登记，避免出现户籍管理混乱等问题，公安部门通常会要求非婚生子女上男方户口时提供亲子鉴定报告。这是户籍管理程序中的一个重要环节，有助于建立准确、完整的人口信息系统，也符合国家对于人口管理和社会秩序维护的要求。

   如果遇到这种情况，你需要按照当地户籍管理部门的要求，选择具有资质的鉴定机构进行亲子鉴定，然后凭亲子鉴定报告等相关材料为孩子办理落户手续。