仲裁生效后与单位有债务纠纷，可按以下方式处理：
一、自动履行

• 双方应自觉按照仲裁裁决结果履行各自义务。若单位需支付拖欠的工资、经济补偿金等，应按时足额支付；若劳动者需归还公司财物或办理离职手续等，也应积极配合。
  二、申请强制执行
• 适用情形：若单位在仲裁裁决规定的履行期限内未履行义务，劳动者有权向法院申请强制执行。
• 所需材料：包括强制执行申请书、生效的仲裁裁决书原件及复印件、申请执行人的身份证明等。
• 执行措施：法院可采取查封、扣押、冻结、拍卖被执行人财产等措施，以迫使被执行人履行义务。
• 法律依据：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四十七条，对于特定类型的劳动争议，如追索劳动报酬、工伤医疗费等不超过当地月最低工资标准十二个月金额的争议，仲裁裁决为终局裁决，自作出之日起即发生法律效力。若单位不履行，劳动者可申请强制执行。
  三、协商和解或再次寻求法律救济
• 协商和解：在仲裁生效后，双方仍可尝试通过协商达成和解协议，重新约定履行方式和期限。和解协议具有合同效力，双方应自觉履行。
• 再次寻求法律救济：若存在法定情形，如仲裁裁决适用法律错误、违反法定程序等，单位可向仲裁委员会所在地的中级人民法院申请撤销裁决。但需注意，撤销裁决的申请需在收到裁决书之日起六个月内提出。