抵押权证明上银行盖业务专用章在一定条件下是有效的。以下是对此问题的详细分析：

一、抵押权证明与抵押登记

1. 抵押权证明的性质：抵押权证明是证明抵押权设立及抵押物具体情况的法律文件。其有效性不单纯取决于印章类型，而需结合抵押登记等法定程序综合判断。
2. 抵押登记的效力：根据《中华人民共和国民法典》第四百零二条，以建筑物等财产抵押的，应当办理抵押登记，抵押权自登记时设立。因此，抵押登记是抵押权生效的核心要件，印章仅作为形式要件之一。

二、业务专用章的效力分析

1. 业务专用章的用途：业务专用章通常用于银行日常业务操作，如文件签署、业务确认等。其效力需结合具体使用场景和银行内部规定判断。
2. 盖章效力的认定：
   • 若银行内部规定或行业惯例允许业务专用章用于抵押权证明，且该证明已依法办理抵押登记，则盖章行为有效。
   • 若银行内部规定禁止业务专用章用于此类文件，或盖章行为存在瑕疵（如未加盖清晰、未附授权文件），则可能影响证明效力。但瑕疵本身不直接导致抵押权无效，需结合其他证据综合判断。

三、确保抵押权有效的建议

1. 核实银行内部规定：在接受抵押权证明时，应要求银行提供盖章授权文件或内部规定，确认业务专用章的使用范围。
2. 优先办理抵押登记：无论印章类型如何，抵押登记是抵押权生效的必要条件。务必确保抵押物已依法登记，并留存登记证明。
3. 保留完整证据链：除抵押权证明外，还应保存抵押合同、贷款合同、银行授权文件等，以证明抵押行为的合法性和真实性。