单方否认性关系时，需根据具体情况，通过合法途径收集证据，以证明或反驳性关系的发生，并寻求法律帮助。
一、理解性关系指控的法律背景

1. 强奸罪定义：依据《中华人民共和国刑法（2023修正）》第二百三十六条，强奸罪指违背妇女意志，使用暴力、胁迫或其他手段强行与妇女性交。若单方否认性关系，而另一方指控强奸，关键在于是否违背妇女意志及是否使用不当手段。
2. 特殊职责人员性关系：根据《中华人民共和国刑法（2023修正）》第二百三十六条之一，对已满十四周岁不满十六周岁的未成年女性负有特殊职责的人员，与该未成年女性发生性关系的，即使未成年女性同意，也构成犯罪。
   二、收集证据以证明或反驳性关系
3. 直接证据：包括物证（如衣物、床单被褥上的体液、血迹等痕迹，以及通讯设备中的聊天记录、电子邮件）、视听资料（如合法获取的现场录音录像、照片或视频）、书面材料（如对方事后承认发生性关系的保证书、悔过书）。
4. 间接证据：包括证人证言（如现场证人、事后证人）、时间线证据（如共同出现的地点、时间等）、相关文件（如合同、收据等，虽不直接证明性关系，但能辅助说明双方存在某种联系）。
   三、寻求法律帮助与应对策略
5. 咨询专业律师：在收集证据过程中，若遇困惑或不确定，应及时咨询专业律师。律师可根据具体情况提供个性化建议和指导，确保取证工作的顺利进行，并制定应对策略。
6. 配合司法程序：若警方或法院介入，应积极配合调查，如实陈述事实，不隐瞒关键信息，也不编造虚假内容。出庭应诉时，保持冷静理性，尊重法律判决。