强迫交易罪中，被告投入的运输成本不能作为减轻或免除其刑事责任的依据。以下是对此问题的详细分析：
一、强迫交易罪的构成要件

1. 客观方面：根据《中华人民共和国刑法》第二百二十六条，强迫交易罪表现为以暴力、威胁手段强买强卖商品、强迫他人提供或接受服务等行为，且情节严重。运输成本是交易过程中的一个环节，但并非决定是否构成强迫交易罪的关键因素。
2. 主观方面：行为人需具有直接故意，即明知自己的行为会强迫他人进行交易，仍希望或放任这种结果发生。运输成本的投入，并不改变行为人强迫交易的主观故意。
   二、运输成本与强迫交易罪的关系
3. 运输成本不改变强迫交易的性质：无论被告是否投入了运输成本，只要其使用了暴力或威胁手段强迫他人进行交易，且情节严重，就构成了强迫交易罪。
4. 运输成本不影响量刑：在量刑时，法院会综合考虑犯罪情节、手段、后果以及被告人的主观恶性等因素。运输成本并非法定量刑情节，不能作为减轻或免除刑事责任的依据。
   三、司法实践中的认定
   在司法实践中，法院会严格依据法律规定和案件事实来认定强迫交易罪。即使被告投入了运输成本，但如果其强迫交易的行为情节严重，仍会受到法律的制裁。