仅有转账凭证，法人借款给公司的款项有可能通过法律途径要回，但需结合其他证据综合判断。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第十六条，原告仅依据金融机构的转账凭证提起民间借贷诉讼，被告抗辩转账系偿还双方之前借款或者其他债务的，被告应当对其主张提供证据证明。被告提供相应证据证明其主张后，原告仍应就借贷关系的成立承担举证责任。

二、影响案件结果的关键因素

1. 转账凭证的真实性与完整性：

• 转账记录需真实有效，包含金额、时间、双方账户信息等关键要素。
• 若转账凭证上备注有“借款”等字样，将增强借贷关系的证明力。

2. 辅助证据的补充作用：

• 聊天记录或通话录音：若包含关于借款金额、用途、还款时间等关键信息的明确提及，可与转账凭证相互印证。
• 证人证言：虽证明力相对较弱，但在无其他直接证据时，仍可作为辅助证据。

3. 被告的抗辩及举证：

• 若被告提出合理抗辩（如转账为投资款、分红等）并提供证据支持，可能导致原告败诉。
• 法院将重点审查被告证据的真实性、关联性及证明力。

三、提高胜诉概率的建议

• 及时补全证据链：尝试通过书面形式要求对方确认借款事实。
• 强化间接证据关联性：整理与借款相关的背景资料，如资金用途说明等。
• 主动申请调查取证：在必要时请求法院调取银行流水明细等第三方证据。