续签合同直接领导同意而HR不同意时，应依据法律法规处理，核心在于确保劳动合同变更的合法性与协商一致性。具体分析如下：
一、劳动合同变更的法定原则

1. 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，劳动合同的变更必须经用人单位与劳动者协商一致，并采用书面形式。直接领导同意不代表用人单位整体意志，HR作为人力资源管理部门，其意见在合同变更中具有关键作用。
2. 若HR不同意续签或变更条款，用人单位不得单方面强行变更，否则可能构成违法变更，需承担法律责任。
   二、处理方式与法律后果
3. 重新协商：用人单位应与劳动者就续签条件进行充分沟通，尝试达成一致。如劳动者对HR提出的条件有异议，可提出合理诉求，双方寻求妥协方案。
4. 按原合同续签：若无法就变更条款达成一致，用人单位可选择按原劳动合同条款续签，以保障劳动者权益并避免法律风险。
5. 终止合同与经济补偿：若用人单位决定不续签，且不符合《劳动合同法》第四十六条规定的无需支付经济补偿的情形（如用人单位维持或提高原条件续订而劳动者拒绝），则需按第四十七条向劳动者支付经济补偿。
   三、操作建议与风险防范
6. 保留证据：无论是协商过程中的沟通记录还是书面通知，均应妥善保留，以备劳动争议时证明己方主张。
7. 依法处理：遵守法定程序，如提前通知劳动者不续签意向、明确告知终止原因及经济补偿方案等。
8. 避免违法解除：不得以劳动者不同意续签为由，单方面降低工资待遇或采取其他不当措施迫使劳动者离职，否则可能构成违法解除，需支付赔偿金。