乙方恶意将借条变更为欠条合同，将面临多重法律后果。以下是对此行为的详细法律分析：
一、法律效力的变化与证据问题

1. 无效性：借条与欠条在法律上具有不同的性质和证明力。借条通常证明借贷关系的存在，而欠条则可能基于多种原因产生。乙方未经甲方同意，恶意将借条变更为欠条，此变更通常被视为无效。因为任何对合同内容的变更都应得到双方的共同认可，擅自修改会破坏合同的真实性和合法性。
2. 证据效力受影响：恶意变更合同内容属于对证据的篡改，这将严重影响变更后的合同在民事诉讼中的证明力。如果甲方对变更内容提出异议，并能提供合理说明，法院很可能不会采信该被更改过的合同内容。
   二、法律责任
3. 民事赔偿责任：若因乙方恶意变更合同给甲方造成损失，如导致甲方错误地安排还款计划或额外支出费用，乙方需对这些损失承担赔偿责任。
4. 行政处罚：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，乙方恶意变更合同的行为可能构成伪造证据，法院可以根据情节轻重对乙方予以罚款、拘留等处罚。
5. 刑事责任：若乙方通过恶意变更合同，虚构事实、隐瞒真相，骗取甲方更多财产，且达到一定数额标准，可能构成诈骗罪。同时，若该行为被认定为伪造证据，且情节严重，还可能涉嫌伪造证据罪，依法追究刑事责任。
   三、信用与声誉损害
6. 信用记录受损：恶意变更合同的行为将被记录在司法系统中，对乙方的信用状况产生负面影响，影响其日后的经济活动。
7. 社会评价降低：此行为违背了诚实信用原则，损害了司法公信力，可能导致乙方在社会上的评价降低。