管理人与有担保债权人协商管理人报酬时，确实存在上限规定。以下是对此问题的详细解答：
一、报酬比例的基本规定
根据《最高人民法院关于审理企业破产案件确定管理人报酬的规定》，管理人对担保物管理工作的报酬比例，依据债务人最终清偿的财产价值总额分段确定。具体比例如下：

1. 不超过100万元的部分，报酬在12%以下确定；
2. 超过100万元至500万元的部分，报酬在10%以下确定；
3. 超过500万元至1000万元的部分，报酬在8%以下确定；
4. 超过1000万元至5000万元的部分，报酬在6%以下确定；
5. 超过5000万元至1亿元的部分，报酬在3%以下确定；
6. 超过1亿元至5亿元的部分，报酬在1%以下确定；
7. 超过5亿元的部分，报酬在0.5%以下确定。
   二、报酬比例的特殊情况与调整
8. 高级人民法院的浮动范围：高级人民法院可根据实际情况，在上述比例基础上，于30%的浮动范围内制定符合当地的管理人报酬比例，并需公告及报最高人民法院备案。
9. 协商与法院调整：若管理人与担保权人就报酬数额无法协商一致，可向法院提出申请，由法院参照相关规定确定报酬，但不得超出规定的比例限制范围的10%。
   三、报酬的支付与限制
10. 担保权人优先受偿的担保物价值，不计入上述财产价值总额中计算报酬。
11. 管理人聘请其他社会中介机构或人员协助工作，所需费用应从其报酬中支付。