债务人明确债务不存在拒绝履行义务后，债权人通过微信、短信催收，若满足一定条件，诉讼时效可以中断。具体分析如下：
一、法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第一百九十五条，权利人向义务人提出履行请求，是诉讼时效中断的情形之一。因此，债权人通过微信、短信向债务人催收，属于提出履行请求，有可能导致诉讼时效中断。
二、中断条件

1. 催收内容明确：微信、短信中必须清晰、具体地表达债权人要求债务人偿还债务的意思，包括债务的具体金额、借款时间、还款要求等。
2. 发送对象准确：催收信息必须发送给正确的债务人，误发给与债务无关的第三人，不能产生诉讼时效中断的效果。
3. 成功到达债务人：催收信息需要成功到达债务人的手机终端，通常显示已送达即可视为到达。
4. 证据留存：债权人应妥善留存微信、短信的原始记录，包括截图、录屏等，以证明催收行为的发生和内容。
   三、特殊情形考虑
   若债务人明确表示债务不存在并拒绝履行，债权人仍需通过合法途径，如提起诉讼或申请仲裁，来维护自身权益。此时，微信、短信催收虽可能不直接导致诉讼时效中断，但可作为后续法律程序的证据之一。