不懂行和懂行专业人签的合作协议是否有效，取决于多个关键要素。

1. 主体合格：签订协议的双方必须具备相应的民事行为能力。完全民事行为能力人可以独立实施民事法律行为，包括签订合作协议。限制民事行为能力人实施的与其年龄、智力、精神健康状况相适应的民事法律行为有效，其他行为需经法定代理人同意或追认。无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。
2. 意思表示真实：协议的签订必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。若一方通过不正当手段使另一方违背真实意愿签订协议，受损害方有权请求撤销该协议。即使一方不懂行，但如果另一方已清晰、明确地向其说明了协议内容，并且其在充分理解后表达了订立协议的意愿，那么该协议可认定为有效。
3. 内容合法合规：协议内容不得违反法律法规的强制性规定，不得违背公序良俗。涉及非法活动或损害社会公共利益、侵害他人合法权益的协议无效。
4. 形式合法：某些类型的协议需采用特定形式才能生效，如书面形式。未采用法定形式的协议可能影响其效力。但形式要求并非绝对，关键在于协议内容是否真实、合法。