军队判决赔偿款是否需要开发票，取决于该赔偿款是否与增值税应税行为相关。以下是对此问题的详细分析：
一、不需要开发票的情形

1. 非应税行为产生的赔偿：若赔偿款并非基于销售商品、提供应税劳务或服务等增值税应税行为，则无需开具发票。例如，因侵权行为导致的人身伤害、财产损失等获得的赔偿，这些赔偿不属于增值税应税范围。
2. 法律依据与会计处理：根据《中华人民共和国发票管理办法》及其实施细则，发票主要用于购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，作为收付款凭证。而军队判决的赔偿款通常不属于这些经营活动范畴。支付方可以凭法院的判决书、付款凭证等相关资料作为入账依据。
   二、需要开发票的情形
3. 应税行为产生的价外费用：若赔偿款与销售货物、提供应税劳务或服务等增值税应税行为相关，且属于价外费用性质（如违约金、滞纳金、赔偿金等），则需要开具发票。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及其实施细则，销售额包括纳税人销售货物或者应税劳务向购买方收取的全部价款和价外费用。
4. 会计处理与税务合规：在这种情况下，赔偿款的支付和收取都需要按照税法规定进行会计处理，确保税务合规性。支付方和收款方都应妥善保管好相关凭证和资料，以备税务部门检查。