建筑垃圾转运站无证运营将面临严厉的法律制裁，具体处理措施如下：
一、责令停止运营与整改
- 相关部门将首先责令无证运营的建筑垃圾转运站立即停止运营活动，防止违法行为继续扩大。
- 要求限期办理相关运营许可证件，如建筑垃圾处置核准等，以确保其合法运营。
二、罚款处罚
- 根据《城市建筑垃圾管理规定》，未经许可擅自从事建筑垃圾运输或处置的，将给予警告，并处5000元以上3万元以下罚款。
- 若存在违法所得，还将面临没收违法所得，并处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下罚款。
三、其他法律后果
- 暂扣或没收运输工具：为防止违法运输行为继续，执法部门有权暂扣违法运输建筑垃圾的车辆等运输工具。
- 刑事责任：若违法行为构成犯罪，如非法经营罪等，将依法追究刑事责任，具体量刑由法院根据案件具体情况确定。
