有权冻结银行账户的部门主要包括人民法院、税务机关、海关等。这些部门在特定情况下，可以依法对银行账户进行冻结。
一、人民法院
在民事执行过程中，人民法院可以依据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》对被执行人的银行账户进行冻结。这通常发生在被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务时，人民法院有权向有关单位查询被执行人的存款情况，并有权扣押、冻结、划拨、变价被执行人的财产。
二、税务机关
根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，税务机关在调查税收违法案件时，经设区的市、自治州以上税务局（分局）局长批准，可以查询案件涉嫌人员的储蓄存款。如果发现纳税人有逃避纳税义务行为，税务机关可以责成纳税人提供纳税担保。如果纳税人不能提供纳税担保，经县以上税务局（分局）局长批准，税务机关可以采取税收保全措施，包括书面通知纳税人开户银行冻结纳税人的金额相当于应纳税款的存款。
三、海关
在《中华人民共和国海关法》中，海关在调查走私案件时，经直属海关关长或者其授权的隶属海关关长批准，可以查询案件涉嫌单位和涉嫌人员在金融机构、邮政企业的存款、汇款。此外，如果进出口货物的纳税义务人在规定的纳税期限内有明显的转移、藏匿其应税货物以及其他财产迹象的，海关可以采取税收保全措施，包括书面通知纳税义务人开户银行暂停支付纳税义务人相当于应纳税款的存款。
综上所述，人民法院、税务机关和海关等部门在符合法律规定的情况下，有权对银行账户进行冻结。