民间借贷纠纷案件法院调解书作出后，一般不能就利息另案起诉，但存在例外情况。以下是对此问题的详细分析：
一、调解书的法律效力

1. 根据相关法律规定，法院主持下达成的调解协议，一旦法院制作调解书并送达双方当事人，该调解书即发生法律效力，与生效判决具有同等效力。这意味着，调解书所确定的内容，包括本金和利息的支付，对双方当事人均具有约束力。
2. 当事人通常不能就同一民间借贷纠纷再次起诉，包括就利息部分单独提起诉讼。这是因为调解书已经对双方的权利义务进行了明确，且具有强制执行力。
   二、例外情况
3. 调解违反自愿原则：如果当事人有证据证明调解违反自愿原则，例如是在被胁迫或欺诈的情况下达成的调解协议，那么可以申请再审。经人民法院审查属实的，应当再审，案件会重新进行审理。在再审过程中，当事人可以就利息等问题提出主张。
4. 调解协议内容违法：如果调解协议的内容违反法律，例如约定的利息超过了法定上限，那么当事人也可以申请再审。在再审中，法院会对调解协议的合法性进行审查，并作出相应的判决。
5. 发现新证据：在极少数情况下，如果当事人发现新的证据，足以推翻原调解书的内容，那么也可以申请再审或另行起诉。但这种情况较为少见，且需要满足严格的法律条件。