信用证交单超过21天但未过有效期时，应优先与开证行及开证申请人沟通，了解是否接受交单并考虑修改信用证有效期或采用其他解决方案。
一、与开证行及开证申请人沟通

1. 联系开证行：立即与开证行取得联系，询问是否接受超过21天但未过有效期的交单。部分银行可能根据实际情况给予一定宽限期或提供其他解决方案。
2. 通知开证申请人：及时告知开证申请人信用证交单时间的情况，并解释原因，争取其理解与支持。双方可协商是否接受其他支付方式或等待重新申请信用证。
   二、修改信用证有效期
3. 适用条件：若买卖双方合作关系良好，且开证申请人有继续履行合同的意愿，可考虑修改信用证有效期。
4. 具体操作：开证申请人向开证行提出修改信用证有效期的申请，开证行审核通过后，发出信用证修改通知书，延长信用证的有效期。
   三、其他解决方案
5. 不符点交单：若货物已交付且市场行情对开证申请人有利，可尝试不符点交单，但需承担开证行拒绝接受不符点并拒付货款的风险。
6. 采用其他结算方式：双方可协商采用电汇（T/T）、托收等其他结算方式，但需注意不同结算方式下的风险和成本。
7. 重新申请信用证：若其他解决方案均不可行，且双方仍有继续交易的意愿，可考虑重新申请一份新的信用证，确保所有条款和条件符合当前交易情况。