在交通事故中，若己方为主要责任，对方为次要责任，双方是否都有交强险并不影响交强险的赔付原则，且双方车辆若投保了交强险，均应在责任限额内进行赔偿。具体分析如下：
一、交强险的赔付原则

1. 不分主次责任：交强险，全称“机动车交通事故责任强制保险”，其赔偿原则是不分主次责任。根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，只要被保险车辆在事故中有责任，无论责任大小，保险公司都应在交强险责任限额内按实际损失进行赔付。
2. 赔偿范围与限额：交强险的赔偿范围包括死亡伤残赔偿、医疗费用赔偿和财产损失赔偿，责任限额分别为18万元、1.8万元和2000元。这些限额是保险公司在每次保险事故中对所有受害人所承担的最高赔偿金额。
   二、双方都有交强险时的赔付情况
3. 双方交强险同时赔付：在交通事故中，若双方车辆都投保了交强险，且己方为主要责任，对方为次要责任，那么双方的交强险将同时发挥作用。对方的交强险会在责任限额内赔偿己方的损失，同样，己方的交强险也会在责任限额内赔偿对方的损失。
4. 超出交强险限额的赔偿：如果交强险的赔偿无法满足实际需求，超出的部分将由双方按照各自的责任比例来分担。在司法实践中，主要责任人通常需承担总赔偿金额的70%左右，而次要责任人则需承担约30%的赔偿责任。如果双方还投保了商业险，超出交强险赔偿限额的部分可以由商业险来承担。