担保案件中法院缺席判决的后果，需分原告、被告两种情况讨论，具体如下：
一、原告缺席

1. 按撤诉处理：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十六条，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以按撤诉处理。这意味着原告主动放弃了本次诉讼请求，若后续想要再次起诉，需重新经历立案、送达、审理等程序。
2. 承担诉讼费用：原告缺席还可能导致其需要承担案件受理费等诉讼费用。
   二、被告缺席
3. 案件继续审理：被告缺席时，案件不会因此中止，法院会依据原告提供的证据及被告已提交的诉讼材料、答辩状进行审理。
4. 承担败诉风险：由于被告未参与法庭调查与辩论，未能提出对自己有利的主张和证据，因此面临较大的败诉风险。法院可能根据原告的主张和证据作出对被告不利的判决。
5. 缺席判决的效力：缺席判决与普通判决具有同等法律效力，一旦作出，被告必须履行判决内容，否则将面临强制执行的风险。法院有权采取查询、冻结、划拨存款，查封、扣押、拍卖财产等强制措施。
6. 特殊强制措施：对于必须到庭的被告（如负有赡养、抚育、扶养义务等），若经两次传票传唤仍无正当理由拒不到庭，法院有权采取拘传等强制措施。