汽车在充电中发生自燃烧了别人的车，第三者保险是否负责赔偿需视情况而定。以下是对此问题的详细分析：

一、责任主体及判定

1. 生产者或销售者责任
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千二百零二条，因产品存在缺陷造成他人损害的，生产者应当承担侵权责任。若销售者存在过错，如明知产品缺陷仍销售，也应承担赔偿责任（《中华人民共和国产品质量法》第四十二条）。
   • 责任判定：若汽车自燃是由于产品本身存在质量缺陷（如电池故障、线路设计不合理等）导致的，生产者或销售者需承担赔偿责任。
2. 汽车所有人或使用人责任
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百六十五条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
   • 责任判定：若汽车自燃是由于所有人或使用人的过错行为（如违规私拉乱接电线充电、使用不合格的充电设备等）导致的，责任应由所有人或使用人承担。
3. 第三方责任
   • 责任判定：若汽车自燃是由第三方的故意破坏或过失行为（如充电桩的线路老化未及时维修等）引发的，责任应由第三方承担。

二、第三者保险的赔付规则

1. 交强险
   • 赔偿范围：主要用于赔偿因道路交通事故造成的第三者人身伤亡和财产损失。
   • 赔偿限额：有责情况下财产损失赔偿限额为2000元，无责情况下为100元。
2. 商业第三者责任险
   • 赔偿范围：在交强险赔偿不足时，对超出部分进行赔偿。
   • 赔偿限额：根据车主选择的保额，如5万、10万、20万等。
3. 车辆自燃险
   • 赔偿范围：主要赔偿车辆自身因电器、线路、供油系统故障导致的燃烧损失。若条款约定，也可赔偿因此导致的第三者损失。

三、赔偿流程与建议

1. 及时报警与通知保险公司：事故发生后，应立即报警并通知保险公司，以便尽快确定责任归属并获得赔偿。
2. 保护现场并配合调查：保护好事故现场，避免移动车辆和受损物品，积极配合保险公司和交警部门的调查。
3. 协商赔偿或法律途径：根据定损结果，与保险公司或责任方协商赔偿事宜。若协商无果，可通过法律途径解决争议。