货物损坏向运输公司索赔违约金是否需要开发票，需根据具体情况判断，主要取决于违约金是否与增值税应税行为相关。以下是对此问题的详细分析：
一、与增值税应税行为相关的违约金
- 合同履行过程中违约：当违约金是在销售货物过程中，因购买方或销售方违约而收取的，且该违约金属于因未履行合同义务而产生的损失赔偿，与增值税应税行为直接相关时，这种违约金应被视为价外费用。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第六条，销售额为纳税人发生应税销售行为收取的全部价款和价外费用，因此，价外费用应并入销售额计算缴纳增值税，并需要开具发票。发票内容应按照销售货物具体情况填写，并在备注栏注明“违约金”字样。
二、与增值税应税行为无关的违约金
- 合同履行前违约：在合同尚未开始履行时，若一方违约并支付违约金，由于此时并未发生实际的经营行为或提供服务，因此这种违约金不属于增值税应税范围。根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，虽然所有单位和从事生产、经营活动的个人在购买商品、接受服务以及从事其他经营活动支付款项，应当向收款方取得发票，但此情况下的违约金支付并未构成经营活动中的款项支付，因此无需开具发票。收取违约金的一方可以出具收据，详细列明违约金的金额、支付方和收款方等信息，作为收付款的凭证。
- 非应税行为违约：如果违约金并非因为增值税应税行为而产生的损失赔偿，例如因延迟交货（但合同未实际履行或延迟交货不构成应税行为的一部分）、提前解约等非应税行为支付的违约金，那么这种违约金就不属于增值税应税范围，无需开具发票。此时，收取违约金的一方可以出具收据或其他合法凭证作为收付款的依据。
