担保公司代偿协议是与债权人签订的。以下是对此问题的详细分析：
一、担保公司代偿协议的性质
担保公司代偿协议，本质上是一种保证合同或担保合同的延伸。根据《中华人民共和国民法典》第六百八十一条，保证合同是为保障债权的实现，保证人和债权人约定，当债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的情形时，保证人履行债务或者承担责任的合同。担保公司作为保证人，在债务人无法履行债务时，根据协议约定代为偿还债务，从而取得对债务人的追偿权。
二、签订主体

1. 担保公司：作为保证人，担保公司需具备代为清偿债务的能力，并愿意在债务人无法履行债务时承担代偿责任。
2. 债权人：作为主债权债务关系中的权利人，债权人与担保公司签订代偿协议，旨在确保在债务人无法履行债务时，能够通过担保公司的代偿实现债权。
   三、法律依据与合同内容

• 法律依据：担保公司代偿协议的签订，主要依据《中华人民共和国民法典》中关于保证合同的相关规定，特别是第六百八十一条和第六百八十八条，明确了保证人的责任和债权人的权利。
• 合同内容：代偿协议应明确约定担保范围、担保期限、代偿方式、追偿权等关键条款，以确保双方权益得到充分保障。