在借条丢失仅有催款短信的情况下，法院的判决会综合考虑多方面因素，不会仅凭催款短信就作出裁决。以下是对此问题的详细分析：
一、催款短信的法律效力

1. 证据效力有限：催款短信虽能证明出借人曾向借款人主张过权利，但其本身作为单一证据，证明力较弱。它无法直接证明借贷关系的成立、借款金额、借款时间等关键信息。
2. 需结合其他证据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，证据应具有真实性、合法性、关联性。因此，催款短信需与其他证据（如转账记录、聊天记录、证人证言等）相结合，形成完整的证据链，才能更好地证明借贷关系的存在。
   二、法院审理的重点
3. 借贷关系的真实性：法院会审查是否存在真实的借贷关系，包括借款的合意、款项的交付等。在仅有催款短信的情况下，法院会要求出借人提供其他证据来佐证借贷关系的真实性。
4. 借款人的抗辩：借款人可能会提出抗辩，如已偿还借款、不存在借贷关系等。此时，法院会要求借款人提供相应证据来支持其抗辩理由。
5. 证据的充分性：法院会综合评估双方提供的证据，判断出借人是否完成了举证责任。若出借人无法提供充分证据证明借贷关系的存在，则可能承担败诉风险。
   三、可能的判决结果
6. 支持出借人诉求：若出借人能提供充分证据（包括但不限于催款短信、转账记录等）证明借贷关系成立且借款人未偿还借款，法院可能会支持出借人的诉讼请求。
7. 驳回出借人诉求：若出借人无法提供充分证据证明借贷关系的存在或借款人提供了有效抗辩证据，法院可能会驳回出借人的诉讼请求。