合同约定欠50万工钱每日千分之五的违约金，在法律上是允许的，但需满足一定条件。以下是对此问题的详细分析：

一、合同约定的法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》第五百八十五条：当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。这表明，合同双方有权在合同中约定违约金条款。

二、违约金的合理性及调整

1. 合理性判断：虽然法律允许合同双方约定违约金，但违约金的数额应当与实际损失相符。每日千分之五的违约金，即年化利率约为182.5%（0.5%×365），这一比例显著高于一般民间借贷的利率上限（如一年期贷款市场报价利率的四倍），也远高于常规商业合同中的违约金比例。因此，该违约金条款的合理性存疑。
2. 法律调整机制：若约定的违约金过分高于因违约造成的实际损失，法院或仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。这意味着，即使合同中约定了每日千分之五的违约金，若债务人能证明该违约金过分高于实际损失，仍有可能获得法院或仲裁机构的调整。

三、实际操作建议

1. 明确实际损失：在约定违约金时，合同双方应尽可能明确实际损失的范围和计算方法，以便在发生争议时能够提供有力的证据支持自己的主张。
2. 合理约定违约金：违约金条款的约定应合理、公平，既要考虑违约方的违约成本，也要兼顾非违约方的实际损失。避免约定过高或过低的违约金，以免引发不必要的法律纠纷。
3. 及时寻求法律救济：若一方认为约定的违约金不合理或过分高于实际损失，应及时向法院或仲裁机构提出请求，以便根据实际情况进行适当调整。