民办学校双方签约的协议并不必然属于无效合同，其有效性取决于是否满足法定条件。以下是对此问题的详细分析：
一、合同成立的条件

1. 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。对于民办学校双方签约的协议，若双方均已签字或盖章，且合同内容不违反法律法规的强制性规定，则合同成立。
2. 若协议中明确规定了生效条件，如需经特定部门批准或备案等，则需满足这些条件后合同方能生效。
   二、合同生效的条件
3. 依法成立的合同，自成立时生效，但法律另有规定或者当事人另有约定的除外。根据《中华人民共和国民法典》第五百零二条，民办学校双方签约的协议，在满足成立条件后，若无特殊法律规定或当事人约定，则自成立时生效。
4. 合同内容必须合法合规，不得违反法律法规的强制性规定或违背公序良俗。若协议中存在违法违规或违背公序良俗的条款，则这些条款无效，但不影响合同中其他有效条款的效力。
   三、特殊情况下的合同效力
5. 若协议中约定了特定的生效条件或期限，如需经学校内部审批或满足特定条件后方能生效，则需按照约定执行。
6. 若一方在签订协议时存在欺诈、胁迫等情形，导致对方在违背真实意愿的情况下签订协议，则受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。