单方自行委托鉴定机构出具的鉴定意见，在一定条件下可以成为认定案件事实的证据依据，但需满足法定条件并经质证。
一、可以作为证据依据的情形

1. 鉴定机构和鉴定人具备资质：鉴定机构和鉴定人必须具备相应的法定资质和专业技术职称，确保鉴定意见的合法性和有效性。若鉴定机构或鉴定人不具备相关资质，其出具的鉴定意见将不能作为定案依据。
2. 鉴定程序合法：鉴定过程必须遵循法定程序，包括样本的采集、保存、送检等环节。若鉴定程序存在瑕疵或违法，如样本被污染、篡改，将影响鉴定意见的可靠性。
3. 鉴定意见真实、关联且经质证：鉴定意见必须与案件事实具有关联性，且真实反映案件情况。同时，该意见需经过庭审质证，对方当事人有权提出异议并申请重新鉴定。若对方当事人无异议或异议不成立，鉴定意见可作为证据使用。
   二、不能作为证据依据的情形
4. 鉴定机构或鉴定人不具备资质：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》第九十八条，鉴定机构不具备法定资质，或鉴定事项超出其业务范围、技术条件；鉴定人不具备法定资质、不具有相关专业技术或职称，或违反回避规定的，鉴定意见不得作为定案根据。
5. 鉴定程序违法或方法不当：若鉴定程序违反规定，如未通知当事人到场、未妥善保管检材，或鉴定方法不符合专业规范要求，鉴定意见将被排除。
6. 送检材料不真实或被污染：送检材料来源不明、不真实、不完整，或因污染不具备鉴定条件的，鉴定意见不得作为定案根据。
7. 鉴定意见形式要件欠缺：鉴定文书缺少签名、盖章，或鉴定意见不明确、有歧义的，不得作为定案依据。