甲方预付款支付延迟时，工期的计算需根据合同约定及实际情况，结合法律规定来确定是否顺延及顺延时长。
一、合同有明确约定的情况

1. 顺延工期条款：若合同中明确规定了甲方延迟付款时乙方有权顺延工期，那么乙方在甲方延迟付款时，可依据合同约定直接顺延工期。例如，合同中写明“若甲方未按时支付款项，乙方有权相应顺延工期”。
2. 先付工程款条款：若合同中明确甲方需先支付工程款作为施工前提，甲方延迟付款将直接影响工程正常进行，乙方有权要求顺延工期，并可请求赔偿停工、窝工等损失。
   二、合同未明确约定的情况
3. 符合法定情形：即使合同未明确约定，若甲方延迟付款构成根本违约，严重影响工程正常推进（如导致乙方无法采购主要材料、无法维持正常施工进度等），乙方可基于甲方违约行为要求顺延工期，并请求赔偿停工、窝工等损失。依据《中华人民共和国民法典》第八百零三条，发包人未按照约定提供资金，承包人可顺延工程日期，并请求赔偿损失。
4. 不符合法定情形：若甲方延迟付款未严重影响工程进展，或乙方通过合理安排资金等措施能维持正常施工进度，乙方通常难以主张顺延工期。此时，乙方应积极采取措施减少损失，并追究甲方违约责任。
   三、乙方应对措施
5. 催告与通知：甲方延迟付款时，乙方应及时发出书面通知，催告支付未付款项，并说明可能导致的工期顺延情况，为后续纠纷处理留存证据。
6. 协商延期付款协议：双方可协商签订延期付款协议，明确延期支付的时间和利息计算方式，以减轻延迟付款对工程进度和双方合作关系的影响。