合同中约定既可向法院起诉又可向某市仲裁委申请仲裁的仲裁协议无效。具体分析如下：
一、仲裁协议无效的法律依据
根据《中华人民共和国仲裁法》第五条，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。同时，依据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国仲裁法〉若干问题的解释》第七条，当事人约定争议可以向仲裁机构申请仲裁也可以向人民法院起诉的，该仲裁协议无效。这是因为仲裁和诉讼是两种相互排斥的纠纷解决方式，同时约定两者会导致纠纷解决程序的不确定性，违背了仲裁制度的自愿和明确选择原则，也违反了仲裁的惟一性和终局性。
二、仲裁协议无效的具体情形

1. 约定不明确：若仲裁协议对仲裁事项或仲裁委员会没有约定或约定不明确，且当事人无法达成补充协议，根据《中华人民共和国仲裁法》第十八条，该仲裁协议无效。
2. 存在无效情形：根据《中华人民共和国仲裁法》第十七条，仲裁协议在以下情形下无效：约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围的；无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议；一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的。
   三、仲裁协议无效后的纠纷解决方式
   当仲裁协议无效时，当事人可以向法院提起诉讼来解决争议。此时，双方应按照法定管辖原则，向有管辖权的人民法院提交起诉状及相关证据材料，通过诉讼程序解决纠纷。