借款30万两年后借条签40万的行为，需从合同变更与利息合法性两个维度综合认定。

一、合同变更的认定

根据《中华人民共和国民法典》第五百四十三条，当事人协商一致可变更合同。若双方在两年后重新签订借条，将借款金额从30万变更为40万，需满足以下条件：

1. 双方真实意思表示：变更内容需经双方协商一致，且无欺诈、胁迫等情形（《民法典》第一百四十三条）。若出借人通过威胁、欺骗等手段迫使借款人签署新借条，则变更行为无效。
2. 书面形式要求：借款合同应采用书面形式（《民法典》第六百六十八条）。新借条需明确记载变更后的金额、期限等条款，并由双方签字或盖章确认。
3. 证据链完整性：除新借条外，还需提供资金流转记录（如转账凭证）、沟通记录（如短信、录音）等辅助证据，证明变更行为系双方真实意愿。

二、利息合法性的审查

若新借条中的40万包含原30万本金及两年利息，则需审查利息是否合法：

1. 利率上限限制：根据民间借贷利率司法保护规定，借贷双方约定的利率不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍。若超出部分，法院不予支持。
2. 复利计算规则：若新借条将前期利息计入后期本金重新计算（即“利滚利”），需确保前期利息未超过法定上限，且最终本息和不超过以最初借款本金为基数、以法定利率计算的整个借款期间的利息之和。

三、法律后果

1. 有效变更：若新借条符合合同变更要件且利息合法，则借款人需按新约定履行还款义务。
2. 部分无效：若利息超出法定上限，超出部分无效，借款人仅需偿还本金及合法利息。
3. 整体无效：若变更行为存在欺诈、胁迫等情形，或新借条内容违反法律强制性规定（如高利贷），则整个变更行为无效，借款人仍按原借条履行义务。