经济补偿金的计算是按照劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来确定，且该平均工资为应发工资，而非合同工资或实发工资。以下是详细解释：
一、法律依据

1. 《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
2. 《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条：劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
   二、具体分析
3. 应发工资的定义：应发工资是指员工根据工作性质和合同约定应获得的工资总额，涵盖基本工资、岗位工资、绩效工资、奖金、津贴等所有收入形式。
4. 实发工资与应发工资的区别：实发工资为员工实际到手的工资金额，它在应发工资的基础上扣除了个人所得税、社保公积金个人缴纳部分等费用，因此通常低于应发工资。经济补偿金计算时，以应发工资为准，确保劳动者获得公平合理的补偿。
5. 特殊情况处理：若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿金按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。