纸质书面协议在符合法定条件时是有效的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条，当事人订立合同可以采用书面形式，书面形式包括合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。纸质书面协议作为合同书的一种，自然受到法律的保护。
二、有效条件

1. 行为人具备民事行为能力：签订纸质书面协议的双方必须具备相应的民事行为能力，即能够独立实施民事法律行为的能力。这通常要求签订者年满18周岁且精神状态正常，或依法登记注册的法人、其他组织。
2. 意思表示真实：协议的签订必须基于双方的真实意愿，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。只有双方自愿且真实地表达意愿，协议才具有法律效力。
3. 内容合法合规：协议内容必须符合国家法律法规的强制性规定，不得损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益。同时，协议内容也不得违背公序良俗，否则将影响其法律效力。
4. 形式清晰明确：纸质书面协议的形式应清晰明了，条款具体且双方权利义务关系表达准确。协议上应有双方的签字或盖章，并注明签订日期，以确保其法律效力和可追溯性。
   三、特殊情况
   若法律或行政法规规定采用书面形式订立的合同，或者当事人自行约定采用书面形式的，应当严格遵守。未按规定形式签订的，可能影响协议的法律效力。