未按核定的时间和路线运输的处罚，主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定进行。以下是对此问题的详细解答：
一、总体处罚原则
- 机动车驾驶人：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。这一条款为未按核定时间和路线运输的机动车驾驶人提供了基本的处罚依据。
二、具体违规情况及处罚
- 未按指定路线行驶
- 普通道路：不按照道路标志、标线指示的路线行驶，如在单行线上逆行，将依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，处警告或二十元以上二百元以下罚款。
- 高速公路或城市快速路：不按规定车道行驶，如快车道低速行驶、应急车道违法占用，除罚款外，还可能依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》进行扣分，如不按规定车道行驶扣3分；违法占用应急车道，扣6分。
- 特殊管制情况：在交通管制期间，不按照指定路线行驶，同样依据上述法条处罚，并可能因阻碍执行公务面临更严重后果。
- 未按指定时间行驶
- 具体处罚：未按指定时间行驶的处罚措施因地区和具体情况而异，但通常包括警告或罚款。若造成交通事故或严重影响交通秩序，可能面临更严厉处罚。例如，某些城市对货车在特定时段进入市区有限制，违反者将受到罚款处罚。
- 公共交通工具违规
- 城市公共汽（电）车：不按照核定的线路、站点、班次和时间营运，根据相关法规，处1万元以上3万元以下罚款。
- 出租汽车：不按规定线路、时间行驶或乱收费，也将受到相应罚款、停业整顿等处罚。
- 校车：未按规定路线和时间接送学生，由公安机关交通管理部门责令改正，可处200元罚款。
- 其他相关违法行为
- 不按导向车道行驶：在有交通信号灯控制且划有导向车道的路口违规，可能受警告或罚款20元以上200元以下，是否扣分视地区而定。
- 违规进入专用车道：如公交车专用道、特定车辆专用道、非机动车道等，将被罚款100至200元，并扣3分。
