在指控强奸罪时，为保留证据，应采取以下措施：
一、及时报警与配合调查

1. 立即报警：案发后，应尽快向当地公安机关报案，以便警方及时介入，开展现场勘查、提取物证等工作。
2. 详细陈述：向警方如实、详细地描述事件发生的经过，包括时间、地点、犯罪嫌疑人的特征、具体行为等，这些信息将作为重要的证人证言。
   二、保留身体证据
3. 避免清洗：强奸发生后，应避免立即清洗身体，特别是私处，以保留可能残留的生物样本，如精液、毛发、皮屑等。
4. 及时就医：尽快前往医院进行检查和治疗，让医生提取生物样本并记录伤痕。医院的诊断证明、病历等是重要的医疗证据。
5. 拍照留证：在就医前或过程中，如果条件允许，可用清晰照片记录下身体上的伤痕、瘀青等损伤情况，并注明拍照时间和地点。
   三、保护现场与收集物证
6. 不破坏现场：尽量保护好案发现场，避免移动或清理现场物品，以免破坏潜在的物证。
7. 记录现场：用手机拍照或录像记录现场状态，包括打斗痕迹、物品摆放等。
8. 保存物品：案发时所穿的衣物、使用的避孕套、卫生纸等物品应妥善保存，不要清洗，交给警方进行检验。
   四、收集通讯及电子证据
9. 保留聊天记录：如果与犯罪嫌疑人有过短信、微信等通讯交流，涉及案件内容，务必保留并通过截图、录屏等方式固定证据。
10. 通话记录：保存案发前后与犯罪嫌疑人或相关人员的通话记录，包括通话时间、时长等信息，并可向运营商申请调取通话详单。
    五、调取监控与寻找证人
11. 查看监控：检查案发地点附近是否有监控设备，及时向相关部门申请调取监控录像。
12. 寻找证人：如果有其他人目睹了案发过程或听到了受害者的反抗、求救等声音，应尽快获取他们的联系方式，以便为案件提供证言。