海上危险驾驶船的处罚主要依据《中华人民共和国刑法》中关于交通肇事罪的规定。具体分析如下：
一、交通肇事罪的基本处罚

1. 根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役。
2. 若交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑。
3. 因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。
   二、海上危险驾驶船的特殊情形
4. 海上驾驶船舶若因违反交通运输管理法规，如超速、超载、酒驾、违规操作等，导致发生重大事故，同样适用上述交通肇事罪的处罚规定。
5. 若海上驾驶行为构成危险驾驶罪的其他情形（如追逐竞驶、醉酒驾驶等，虽《刑法》第一百三十三条之一主要针对道路机动车，但海上驾驶若存在类似危险行为且情节严重，可参照此精神进行处罚，具体需结合实际情况及司法解释），则可能面临拘役及罚金的处罚。
   三、其他相关处罚
6. 除了刑事处罚外，海上危险驾驶船还可能面临行政处罚，如吊销船员适任证书、罚款等。
7. 若因危险驾驶行为导致民事赔偿责任，还需承担相应的民事赔偿。