双方在一起生活六年但没办结婚证，并不构成合法的夫妻关系。
根据《中华人民共和国民法典》第一千零四十九条的规定，要求结婚的男女双方必须亲自到婚姻登记机关办理结婚登记。完成登记后，婚姻关系即具有法律效应。未办理结婚登记的，应当补办登记。因此，仅仅共同生活而未办理结婚登记，并不构成法律上的夫妻关系。
此外，双方必须满足一定的条件才可以办理结婚登记，包括双方必须自愿结婚、男不得早于二十二周岁、女不得早于二十周岁、双方不能有直系血亲和三代以内旁系血亲关系等。满足这些条件才可以去婚姻登记机关进行结婚登记，完成登记后双方即确立为合法夫妻。
所以，在一起生活六年但没办结婚证，双方并不被视为合法夫妻。