小三侵害了原配的哪些权利，主要可以从以下几个方面进行分析：
一、婚姻权利

1. 配偶权的侵害：根据《中华人民共和国民法典》第一千零四十二条，禁止有配偶者与他人同居。小三与有配偶者同居的行为，实际上侵害了原配的配偶权，即原配与配偶之间基于婚姻关系的独占性、排他性的权利。
   二、财产权利
2. 夫妻共同财产的侵害：如果小三与有配偶者存在不正当关系，并且有配偶者未经原配同意，将夫妻共同财产用于与小三的共同生活或赠与小三，这将侵害原配对夫妻共同财产的所有权和管理权。原配在此情况下，有权要求小三返还相关财产。
   三、其他权利
3. 精神损害赔偿：小三的行为如果导致原配受到精神损害，如情感上的痛苦、心理压力等，原配有权要求小三承担精神损害赔偿责任。这一权利的保护，虽然不直接来源于某一具体法条，但基于民法中关于侵权责任的一般规定，以及对于精神损害赔偿的司法实践。
   综上所述，小三侵害了原配的配偶权、夫妻共同财产权以及可能的精神损害赔偿权。这些权利的侵害，不仅违反了民法典的相关规定，也违背了社会公德和婚姻家庭伦理。因此，原配在遭受小三侵害时，可以依法维护自己的合法权益。