亲子基因鉴定能保密，且隐私受多重法律保护，具体分析如下：
一、法律保障基础

1. 隐私权保护：根据《民法典》第一千零三十二条，自然人享有隐私权，任何组织或个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人隐私。亲子鉴定中涉及的当事人个人信息、鉴定结果等均属隐私范畴，受法律严格保护。
2. 数据安全规范：《网络安全法》第四十条及《数据安全法》第二十七条明确，网络运营者、数据处理者需采取技术措施保护个人信息，防止数据泄露、毁损或丢失。鉴定机构作为数据处理主体，需依法履行安全保障义务。
   二、鉴定机构的责任
3. 信息收集与使用限制：鉴定机构应明确告知当事人信息收集目的、方式及范围，仅在获得同意后用于鉴定流程，不得向第三方泄露或用于其他用途。
4. 数据加密存储：采用加密技术存储样本信息、检测数据及鉴定结果，确保数据在传输和存储过程中的安全性，防止非法获取或篡改。
5. 人员管理：加强工作人员保密培训，签订保密协议，明确保密责任，对违规泄露信息者依法追究责任。
   三、当事人的自我保护
6. 选择正规机构：优先选择具备资质、信誉良好且隐私保护措施完善的鉴定机构，避免因机构不规范导致信息泄露。
7. 仔细阅读协议：签订委托鉴定协议时，重点关注隐私保护条款，明确机构责任及自身权益，确保协议内容合法合规。
8. 个人信息保护：避免在公共场合讨论鉴定事宜，妥善保管鉴定报告及相关文件，防止信息被他人获取或利用。