男方因强奸罪入狱，女方起诉离婚，法院大概率会判决准予离婚。具体分析如下：
一、法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条：夫妻一方要求离婚的，可由有关组织调解或直接向法院提起离婚诉讼。法院审理时，应进行调解；若感情确已破裂且调解无效，应准予离婚。其中，“其他导致夫妻感情破裂的情形”为准予离婚的法定情形之一。强奸罪虽未明确列举，但其性质恶劣，严重破坏夫妻关系，符合该情形，可作为离婚诉讼的合法依据。
2. 《中华人民共和国民法典》第一千零九十一条：有重大过错导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿。男方犯强奸罪，属于对女方造成重大伤害和过错的情形，女方有权据此提出离婚并请求损害赔偿。
   二、强奸罪对夫妻感情的影响
   强奸罪是严重的刑事犯罪，侵犯女性性自主权，给受害者带来身心创伤。在婚姻中，男方犯强奸罪，不仅违法，更严重破坏夫妻信任和感情基础。此时，夫妻关系名存实亡，继续维持对女方是巨大痛苦和折磨。
   三、离婚条件的满足
3. 夫妻感情破裂：男方犯强奸罪，表明其对女方尊重和关爱已荡然无存，夫妻关系无法修复，感情彻底破裂，符合离婚条件。
4. 调解无效：离婚诉讼中，法院会先尝试调解。但男方犯强奸罪的案件中，因其过错行为严重，调解往往难以取得成效。因此，调解无效时，法院应准予离婚。