小三生的孩子，即非婚生子女，可以凭借亲子鉴定单独立户口，但需满足一定条件并遵循特定流程。
一、法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十一条，非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，任何组织或者个人不得加以危害和歧视。这一规定为非婚生子女上户口提供了法律基础。
二、上户条件与流程

1. 确定亲子关系：非婚生子女上男方户口，首先需明确孩子与男方的亲子关系，通常需进行亲子鉴定。亲子鉴定需由具有合法资质的鉴定机构进行，确保结果具备法律效力。
2. 准备相关材料：包括孩子的《出生医学证明》（若未取得，需申请补发，并可能需提供亲子鉴定报告）、男方的身份证、户口簿，以及亲子鉴定证明（若申请随父落户）。单亲申报的，还需提供男方的书面声明及单身证明。
3. 向公安机关申报：携带上述材料，前往男方常住户口所在地的辖区公安派出所进行申报。
4. 办理落户手续：公安派出所会调查核实材料的真实性和完整性，审核通过后，会为孩子办理落户手续。
   三、单独立户的特殊情况
5. 未成年人单独立户：一般情况下，未成年人不具备完全民事行为能力，无法单独立户。但若父母双亡，未成年人有独立房产且得到法定监护人同意，并满足当地户籍管理部门条件，可能允许单独立户。不过，这种情况与亲子鉴定上户口不直接相关，且较为罕见。
6. 成年人单独立户：若非婚生子女已成年，且拥有独立房产或符合集体户落户条件，可按照相关规定将户口从原家庭户中迁出，单独立户。但这与非婚生子女上男方户口的问题不直接相关。