女方起诉离婚，两个孩子由男方抚养时，女方仍需支付抚养费。具体分析如下：
一、抚养费的法定义务

1. 法律规定：根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十五条，离婚后，子女由一方直接抚养的，另一方应当负担部分或者全部抚养费。这一规定明确了抚养费的支付是父母的法定义务，不因离婚或抚养权的归属而消除。
2. 义务性质：抚养费旨在保障子女的基本生活、教育和医疗需求，确保其健康成长。因此，无论女方是否直接抚养孩子，都需承担这一责任。
   二、抚养费的具体确定
3. 协商确定：抚养费的数额和期限，首先由双方协议确定。双方可根据子女的实际需要、父母的负担能力和当地的生活水平等因素进行协商。
4. 法院判决：若协议不成，可由人民法院判决。法院将综合考虑子女的实际需要、父母的负担能力和当地的生活水平等因素，确定抚养费的数额和支付方式。
   三、特殊情况的处理
5. 双方协商一致：若双方协商一致，且男方明确表示同意女方不支付抚养费，同时男方有能力独自承担抚养孩子的费用，这种约定在不损害子女利益的前提下是有效的。但此类协商约定必须以书面形式确定，以避免未来产生争议。
6. 女方无支付能力：若女方因丧失劳动能力、无其他经济来源等特殊原因确实无法支付抚养费，需提供相关证明材料，并经法院严格审查和认定后，可能根据实际情况调整或免除其支付义务。