若女方报警诬告男方强奸罪，且调解失败后公安机关不立案，男方可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
一、了解不立案原因
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关在决定不予立案时，应制作不予立案通知书，并在三日内送达控告人。男方有权要求公安机关书面或口头说明不立案的具体依据和原因，如证据不足、不符合构成要件、报案人虚构事实等。
二、申请复议与复核
- 申请复议：若男方对公安机关的不立案决定不服，可在收到不予立案通知书后七日内向上一级公安机关申请复议。上级公安机关应在收到复议申请后七日内作出决定，并书面通知男方复议结果。
- 申请复核：若复议后仍不立案，男方可向更上一级公安机关申请复核，以期获得更高级别的审查与决定。
三、向检察院申请立案监督
- 若公安机关仍不立案，男方还可向同级人民检察院提出申诉，要求检察院对公安机关的不立案决定进行监督。检察院将审查公安机关不立案的理由，若认为理由不能成立，将通知公安机关立案，公安机关在接到通知后应当立案。
四、考虑提起刑事自诉（特定情形下）
- 在极特殊情况下，若男方有充分证据证明女方的诬告行为，且公安机关、检察院均未予追究，男方可以考虑向法院提起刑事自诉，但需承担举证责任。
五、收集与保留证据
- 在整个过程中，男方应尽可能收集和保留与案件相关的证据，如聊天记录、通话录音、现场监控等，以便更好地维护自身合法权益。
