强奸案件五年后是否还能立案，需结合追诉时效与证据情况综合判断。
一、追诉时效分析

1. 法定追诉时效：根据《中华人民共和国刑法》第八十七条，强奸罪的追诉时效根据可能判处的最高刑罚确定。基本量刑为三年以上十年以下有期徒刑的，追诉时效为十年；存在加重情节（如多人轮奸、在公共场所当众强奸等），可能判处十年以上有期徒刑、无期徒刑或死刑的，追诉时效为十五年或二十年（若需超过二十年追诉，须报请最高人民检察院核准）。因此，若案件未超过法定追诉时效，公安机关仍可立案。
2. 不受追诉时效限制的情形：根据《刑法》第八十八条，若案件已由司法机关立案侦查或法院受理，犯罪嫌疑人逃避侦查或审判，或被害人在追诉期限内提出控告而司法机关未立案的，不受追诉期限限制。即使超过五年，若符合上述条件，仍可立案。
   二、证据情况对立案的影响
3. 立案条件：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十二条，公安机关认为有犯罪事实需要追究刑事责任时即可立案。即使仅有被害人口供，若其陈述详细且可信，公安机关仍可能立案。
4. 定罪要求：根据《刑事诉讼法》第五十五条，定罪需证据确实、充分，包括定罪量刑事实均有证据证明、证据经法定程序查证属实、综合全案证据排除合理怀疑。仅凭被害人口供无法定罪，需其他证据（如物证、DNA鉴定、证人证言等）佐证。