二级资质建筑企业申请破产时是否需要按照注册资金补齐，需要分情况来看，关键在于股东是否已经完成了对公司注册资本的实缴义务：

    股东已实缴全部注册资金

   根据《中华人民共和国公司法》规定，有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任，股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。如果股东已经按照公司章程的规定，足额实缴了全部注册资金，那么在公司破产时，股东通常不需要再额外按照注册资金数额进行补齐。

   例如，某二级资质建筑企业为有限责任公司，其注册资金为 5000 万元，股东们已经实际缴纳了这 5000 万元，当公司因经营不善申请破产时，股东在出资方面的责任已经履行完毕，不需要再为公司的债务承担超出已出资部分的责任。

    股东未实缴全部注册资金

   在公司破产的情况下，如果股东尚未足额缴纳其认缴的出资，那么根据《中华人民共和国企业破产法》第三十五条规定，人民法院受理破产申请后，债务人的出资人尚未完全履行出资义务的，管理人应当要求该出资人缴纳所认缴的出资，而不受出资期限的限制。

   也就是说，即使公司章程规定的出资期限尚未届满，在公司破产程序中，股东也需要立即缴纳尚未缴纳的出资。例如，某建筑企业注册资金 3000 万元，股东只实缴了 1000 万元，在公司破产时，股东就需要将剩余的 2000 万元补齐，以用于清偿公司债务。