司法协商分期付款后通常会结案，但具体情况要根据不同的司法程序和案件类型来分析：

    民事案件

    一般会结案情况

    - 在民事纠纷中，双方达成司法协商的分期付款协议后，如果是在法院主持下达成的调解协议，法院会制作调解书。当双方按照调解协议约定的分期还款计划履行完毕，案件就会正常结案。

    - 例如，甲起诉乙要求偿还借款 10 万元，在法院调解下，双方达成协议，乙分 10 期偿还，每期 1 万元。当乙按照约定还清所有款项后，法院会将该案件作结案处理。

    可能不结案情况

    - 如果在分期付款过程中，债务人未按照协议约定履行还款义务，债权人可以向法院申请恢复执行原生效法律文书，此时案件就不会结案，而是会重新进入执行程序。

    - 比如上述案例中，乙偿还了 3 期后就不再还款，甲有权向法院申请恢复执行，要求乙一次性偿还剩余的 7 万元及可能产生的利息等费用，案件会继续处于司法程序中。

    刑事案件附带民事赔偿

    通常会结案情况

    - 在刑事案件附带民事诉讼中，如果被告人与被害人就民事赔偿部分达成分期付款协议，并且按照协议履行完毕，附带民事诉讼部分会结案。同时，如果刑事部分已经审理完毕并作出判决，整个案件也会相应结案。

    - 例如，在一起故意伤害案件中，被告人被判处刑罚，同时需向被害人赔偿医疗费等损失 5 万元，双方协商分 5 期支付。当被告人全部支付完毕后，附带民事赔偿部分结案。

    可能不结案情况

    - 若被告人在履行分期付款协议过程中违约，被害人可以向法院申请强制执行。而且，如果刑事部分涉及缓刑等情况，被告人不履行附带民事赔偿协议可能影响其缓刑的执行，案件可能会因这些后续问题而不结案。

    - 比如被告人在缓刑考验期内未按协议赔偿，法院可能会撤销缓刑，对其重新收监执行刑罚，此时整个案件会有新的司法程序推进。