司法协商分期付款后是否结案需要分情况来看：

    可能结案的情况

    民事诉讼

    - 在民事诉讼中，如果双方当事人达成司法协商（通常表现为法院主持下达成调解协议，约定分期付款），且债务人按照调解协议的内容，按时、足额完成了每一期的付款义务。这种情况下，一般视为纠纷已经得到妥善解决，法院会按照程序结案。

    - 例如，甲起诉乙要求偿还借款10万元，经法院调解，双方达成协议，乙分5期偿还借款，每月还款2万元。乙严格按照协议履行了全部还款义务，法院就会结案。

    执行阶段

    - 在执行程序中，申请执行人和被执行人达成执行和解协议，约定分期付款。当被执行人完全履行了和解协议的付款内容后，执行法院可以作执行结案处理。

    - 比如，法院判决丙向丁支付赔偿款5万元，进入执行阶段后，双方达成和解，丙分3期支付，丙支付完毕后，执行案件会结案。

    通常不会结案的情况

    未完全履行协议

    - 如果债务人在司法协商分期付款过程中，出现逾期付款或者未足额付款的违约行为，那么案件通常不会结案。在民事诉讼中，债权人可以依据调解协议向法院申请强制执行；在执行阶段，申请执行人可以申请恢复执行原生效法律文书。

    - 例如，上述乙在偿还了3期后就不再还款，甲可以向法院申请强制执行剩余的4万元欠款，此时案件会继续处于司法程序中。

    达成协议但未履行完毕

    - 即使双方达成了分期付款的协议，但只要债务人尚未完成全部付款义务，案件一般也不会正式结案。法院会持续关注协议的履行情况，以保障债权人的合法权益。