非婚生子有出生证明但上男方户口仍需亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    防止户籍管理漏洞

    避免冒用身份 ：在非婚生育的情况下，可能存在个别人员为了达到某些目的，如获取当地福利、解决上学问题等，利用虚假的出生证明将孩子登记在他人户口上。通过亲子鉴定，可以准确确定孩子与男方之间是否存在生物学上的亲子关系，确保户籍信息的真实性和准确性，防止他人冒用身份进行户籍登记。

    杜绝违规落户 ：一些人可能试图通过不正当手段为不符合落户条件的孩子办理户口。亲子鉴定作为一种科学的验证方式，能够有效杜绝此类违规落户行为，维护户籍管理的正常秩序。

    保障男方合法权益

    明确亲子关系 ：出生证明虽然是孩子出生的一种证明文件，但它并不一定能完全准确地反映孩子的生物学亲子关系。在非婚生育的情况下，男方可能对孩子是否为自己亲生存在疑虑。亲子鉴定可以提供科学的依据，明确男方与孩子之间的亲子关系，保障男方的知情权和合法权益。

    避免潜在纠纷 ：如果不进行亲子鉴定就将孩子登记在男方户口上，未来可能会因为亲子关系的不确定性引发一系列纠纷，如财产继承、抚养责任等问题。通过亲子鉴定提前确定亲子关系，可以避免这些潜在纠纷的发生，维护家庭和社会的稳定。

    遵循相关政策法规

    户籍管理规定 ：目前，各地户籍管理部门对于非婚生子女落户有明确的规定和要求。为了确保户籍登记的准确性和合法性，通常会要求提供亲子鉴定证明。这是户籍管理部门在执行政策过程中的必要程序，旨在规范户籍管理，保障公民的合法权益。

    防止人口拐卖 ：亲子鉴定也是打击人口拐卖犯罪的重要手段之一。通过要求提供亲子鉴定证明，可以有效防止人贩子将被拐卖的儿童通过虚假出生证明落户到他人户口上，从而增加被拐卖儿童被找回的难度。因此，亲子鉴定在保障儿童权益和维护社会安全方面具有重要意义。