非婚生子有出生证明，但上男方户口时仍要求做亲子鉴定，通常有以下几方面原因：

    防止虚假申报户口

   在非婚生育的情况下，存在一些人可能为了各种目的，比如获取拆迁补偿、为他人孩子违规落户等，故意提供不真实的信息和虚假的出生证明。要求进行亲子鉴定是为了通过科学的手段确定孩子与男方之间是否存在生物学上的亲子关系，以保证户籍登记信息的真实性和准确性，维护户籍管理的正常秩序。

    确认亲子关系的法律依据

   虽然有出生证明，但出生证明本身只能证明孩子出生的事实以及登记的父母信息。在法律层面，对于非婚生子女，为了明确亲子权利义务关系，特别是涉及到男方对孩子的抚养责任、继承权等问题，需要有更权威、更具法律效力的亲子关系证明。亲子鉴定报告就是这样一种具有法律效力的证据，能够从法律上确认孩子与男方的亲子关系，从而保障各方的合法权益。

    遵循户籍管理规定

   不同地区的户籍管理政策可能会有所差异，但总体来说，对于非婚生子女上户口的程序会相对严格。一些地方规定，非婚生子女随父落户时，除了出生证明外，还必须提供亲子鉴定证明。这是为了规范户籍管理，防止出现户籍管理漏洞和违法行为。

   如果遇到这种情况，你可以按照当地户籍管理部门的要求，选择具有资质的鉴定机构进行亲子鉴定，取得合法有效的亲子鉴定报告后再办理上户手续。