非婚生子有出生证明但上男方户口时还被要求做亲子鉴定，通常有以下几方面原因：

    防范户口登记中的违法行为

    防止冒名顶替 ：在非婚生育的情况下，可能存在一些人为了某些利益，比如获取拆迁补偿、上学指标等，将孩子冒名登记到男方户口上。要求进行亲子鉴定可以确保孩子与男方存在真实的生物学亲子关系，避免虚假的户口登记行为，维护户籍管理的准确性和严肃性。

    打击拐卖儿童等犯罪 ：一些不法分子可能会通过虚假的出生证明等手段，试图为被拐卖儿童办理户口。通过亲子鉴定，可以有效识别此类违法犯罪行为，保障儿童的合法权益，防止被拐卖儿童被非法“洗白”身份。

    出生证明的局限性

    出生证明信息不准确 ：虽然有出生证明，但出生证明上登记的父亲信息可能存在错误或虚假情况。比如，母亲可能出于各种原因，在出生证明上填写了错误的父亲信息。进行亲子鉴定可以核实孩子与男方的真实亲子关系，以准确登记户口。

    出生证明效力存疑 ：在某些地区，非婚生子的出生证明可能在办理过程中存在不规范的情况，导致其证明效力受到质疑。为了确保户口登记的准确性，公安机关会要求通过亲子鉴定来进一步确认亲子关系。

    法律规定和政策要求

    遵循相关户籍管理规定 ：根据我国户籍管理的相关法律法规和政策，对于非婚生育子女落户的情况，为了保障公民的合法权益和户籍信息的真实性，通常要求提供亲子鉴定证明。这是为了规范户口登记程序，防止出现户籍管理漏洞。

    保护男方权益 ：亲子鉴定也是对男方权益的一种保护。通过科学的鉴定手段，可以确保男方确实是孩子的生物学父亲，避免在不知情的情况下承担非亲生子女的抚养等责任。