非婚生子有出生证明的情况下，上男方户口仍要求做亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    防止户籍登记错误或造假

    出生证明真实性存疑

   虽然出生证明是孩子出生的重要凭证，但在现实中存在虚假出生证明的情况。有些人为了达到给孩子上户口等目的，可能会通过非法途径获取或伪造出生证明。要求进行亲子鉴定可以确保孩子与男方之间的生物学亲子关系真实无误，避免因虚假出生证明导致户籍信息错误登记，维护户籍管理的准确性和严肃性。

    避免抱错孩子等特殊情况

   在医院生产过程中，理论上存在抱错孩子的极小概率。即使有出生证明，也不能完全排除这种可能性。通过亲子鉴定，可以进一步确认孩子与男方的亲子关系，防止因抱错孩子而错误地将他人子女登记在男方户口下。

    保障相关权益和遵守法律规定

    保障男方合法权益

   从男方角度看，亲子鉴定可以确保其承担抚养义务的对象是自己的亲生子女。在非婚生育的情况下，男方可能对孩子是否为自己亲生存在疑虑。进行亲子鉴定有助于明确亲子关系，保障男方在财产继承、抚养权等方面的合法权益。

    符合法律规定和户籍政策

   根据我国相关法律和户籍管理规定，非婚生子女办理户口登记时，为了明确亲子关系、防止人口拐卖等违法犯罪行为，公安机关通常会要求提供具有法律效力的亲子关系证明。亲子鉴定报告是目前证明亲子关系最科学、最准确的依据，所以要求进行亲子鉴定是符合规定的操作流程。

    完善人口信息管理

    建立准确的人口档案

   准确的人口信息对于国家的社会管理、公共服务等方面具有重要意义。通过亲子鉴定确定非婚生子女与男方的亲子关系，可以完善人口档案信息，确保人口数据的真实性和完整性，为国家制定相关政策提供可靠依据。

    便于后续管理和服务

   明确亲子关系后，有助于后续对孩子的教育、医疗、社会保障等方面的管理和服务。例如，孩子在享受相关福利政策时，准确的亲子关系信息可以避免不必要的纠纷和问题。