非婚生子有出生证明，上男方户口时仍要求做亲子鉴定，主要有以下几方面原因：

    防止虚假申报户口

   在非婚生育的情况下，可能存在一些人为了某些利益（如获取拆迁补偿、上学指标等）而故意将孩子户口登记在他人名下的情况。出生证明虽然是孩子出生的一个重要凭证，但它并不能完全排除登记信息被伪造或错误填报的可能性。通过亲子鉴定，可以从生物学角度确定孩子与男方之间是否存在亲子关系，从而保证户口登记信息的真实性和准确性，避免虚假申报户口的情况发生。

    确保孩子权益

   对于非婚生子而言，户口是其享受各种社会福利和权益的重要依据。要求进行亲子鉴定，可以确保孩子确实与男方存在亲子关系，这样孩子才能在合法的基础上获得相应的权益保障，比如继承权、受教育权等。同时，也能避免一些别有用心的人利用非婚生子的身份谋取不正当利益，损害孩子和合法权利人的权益。

    遵循户籍管理规定

   根据我国户籍管理相关规定，非婚生育的子女申报户口时，为了明确孩子的亲子关系和落户的合法性，往往需要提供亲子鉴定证明。这是为了规范户口登记程序，加强户籍管理，维护社会秩序和公共利益。即使有出生证明，由于非婚生育情况相对复杂，为了进一步核实亲子关系，亲子鉴定就成为了必要的补充证明材料。

    保障男方权益

   亲子鉴定也在一定程度上保障了男方的权益。通过科学的鉴定结果，可以让男方更加确定孩子与自己的亲子关系，避免在不知情的情况下承担不属于自己的抚养责任等情况。同时，也为后续可能涉及的亲子权益纠纷提供了明确的证据。

   如果遇到这种情况，你可以按照户籍管理部门的要求，选择具有资质的鉴定机构进行亲子鉴定，完成相关程序后，为孩子顺利办理户口登记。