非婚生子有出生证明，上男方户口时仍要求做亲子鉴定，通常基于以下几方面原因：

    防止户籍管理中的违规行为

    避免虚假申报 ：在户籍管理中，可能存在一些人为了某些利益（如获取拆迁补偿、上学指标等），故意将孩子虚假申报到他人户口下的情况。非婚生育的情况下，家庭关系相对复杂，没有经过婚姻登记这一法定程序的约束，户籍管理部门为了保证户籍信息的真实性和准确性，防止有人利用虚假的出生证明进行户口登记，就需要通过亲子鉴定来确认亲子关系的真实性。

    杜绝拐卖儿童等犯罪行为 ：一些不法分子可能会将拐卖来的儿童通过虚假的出生证明等手段上到他人户口，以此掩盖犯罪事实。要求进行亲子鉴定可以有效防止这种情况的发生，保障儿童的合法权益和社会的治安秩序。

    出生证明本身存在局限性

    信息不准确 ：虽然出生证明是孩子出生的重要凭证，但在实际生活中，可能存在出生证明信息登记错误的情况。比如，在非婚生育的场景下，可能存在母亲为了某种原因填写错误的父亲信息，或者出生证明在办理过程中出现信息录入失误等问题。通过亲子鉴定可以准确核实孩子与申报户口的男方之间是否存在生物学上的亲子关系。

    出生证明造假 ：现实中存在伪造出生证明的现象。一些人为了达到让孩子上户口等目的，可能会制作假的出生证明。户籍管理部门为了避免被虚假证明误导，需要借助亲子鉴定这一科学手段来确定亲子关系的真实性。

    明确法律责任和权益

    保障男方权益 ：对于男方来说，通过亲子鉴定可以明确其与孩子之间的亲子关系，从而确定其在法律上对孩子应承担的抚养义务和享有的权利。在非婚生育的情况下，男方可能对孩子是否为自己亲生存在疑虑，亲子鉴定可以为其提供科学的依据，避免日后可能出现的纠纷。

    保障孩子权益 ：从孩子的角度来看，准确的亲子关系认定有助于其享受应有的权益，如继承男方的财产、获得男方的抚养和教育支持等。亲子鉴定可以为孩子的权益提供更坚实的法律保障。